Valencia, España.- La población española de salmón del Atlántico está compuesta por dos principales grupos ancestrales, que incluyen un grupo Atlántico y un grupo Cantábrico, concluye un nuevo estudio.
Los avances en la genómica del salmón atlántico de los últimos años han llevado al desarrollo de chips densos de polimorfismos de un solo nucleótido (SNP), abriendo así nuevas oportunidades para la investigación de la dinámica genética de las poblaciones.
Chtioui utilizó el panel de 220K SNP de Affymetrix (Aquagene/CIGENE) para caracterizar los patrones de desequilibrio de ligamiento, para estimar el tamaño efectivo a partir dichos patrones y para identificar regiones genómicas que controlan la determinación del sexo en poblaciones españolas de salmón atlántico
«Se genotiparon muestras de seis ríos (Miño, Ulla, Eo, Sella, Urumea y Bidasoa) que cubren toda el área de distribución de la especie en España. Después del control de calidad, se disponía de 187 muestras y más de 150.000 SNPs para los análisis» reportó el científico.
Según el científico «El análisis de estructura poblacional reveló que la población española de salmón atlántico actual está compuesta por dos principales grupos ancestrales. Estos incluyen un grupo Atlántico con individuos de los ríos Miño y Ulla (metapoblación atlántica), y un grupo Cantábrico con individuos de los ríos Sella, Urumea y Bidasoa (metapoblación cantábrica)».
Chtioui concluye que «Hasta donde sabemos, este es el primer estudio que identifica regiones genómicas asociadas a la determinación del sexo en esta especie e investiga la magnitud del tamaño efectivo de la población a partir de datos genómicos»
Referencia (abierta):
Chtioui A. 2016. Exploiting genomic data to estimate effective population size from linkage disequilibrium and to identify genomic regions involved in sex determination in Spanish Atlantic salmon. Tesis de Master. MASTER INTERUNIVERSITARIO EN MEJORA GENÉTICA ANIMAL Y BIOTECNOLOGÍA DE LA REPRODUCCIÓN. Universidad Autónoma de Barcelona, Universidad Politécnica de Valencia, CIHEAM.
https://riunet.upv.es/handle/10251/67951
