Genética

Similitud genética de las poblaciones de concha de abanico en el Perú

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By Milthon Lujan

Lima, Perú – Un estudio concluye que la translocación intensa tiene un efecto remanente entre las poblaciones silvestres de concha de abanico en el Perú, lo que limita la certificación de origen sostenible de los bivalvos de cultivo usando marcadores genéticos.

Los investigadores de Smithsonian Conservation Biology Institute, Oceánica, Biotecnología de Alimentos SAC, Universidad Científica del Sur, Seacorp Perú SAC y de la Universidad de Ingeniería y Tecnología (UTEC) evaluaron la variación del genoma en individuos de la concha de abanico de cinco poblaciones silvestres a lo largo de su distribución natural, usando miles de marcadores SNPs.

“El objetivo fue investigar la influencia de las translocaciones en el largo plazo sobre la actual estructura genética de las poblaciones silvestres de concha de abanico. Nosotros estimamos los niveles de diversidad genómica entre y dentro de las poblaciones silvestres, describimos la estructura espacial de la población, y evaluamos el nivel y la direccionalidad de las translocaciones entre las poblaciones silvestres” reportan los investigadores.

La “concha de abanico” (Argopecten purpuratus) es uno de los bivalvos marinos más exportados por la industria acuícola peruana y una especie importante en el mercado mundial de bivalvos. Esta especie ha estado sujeta a traslocaciones o relocalizaciones locales por décadas, impulsadas por la expansión del cultivo de concha de abanico a lo largo de la costa peruana.

El desarrollo de la acuicultura de concha de abanico en el Perú depende principalmente de la captura de semilla en el medio natural y de las relocalizaciones de individuos jóvenes de poblaciones silvestres. Esto obstaculiza el rendimiento de los productores peruanos en los mercados internacionales.

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“A pesar de ser una de las especies acuícolas más valiosas en el Perú, hasta la fecha es imposible diferenciar lotes de conchas de abanico exportadas silvestres de aquellas producidas de una forma sostenible (acuicultura)” destacan los investigadores.

Definición de translocación

Las traslocaciones de individuos entre poblaciones silvestres de especies marinas con valor comercial es una práctica extendida con consecuencias no del todo conocidas.

Beaumont (2000) definió a la translocación “como el movimiento de individuos realizada por el hombre desde una población dada a otra dentro del rango de distribución de la especie”. Esta práctica sirve para objetivos específicos, siendo la principal la recuperación de poblaciones diezmadas para asegurar las cosechas.

La intensidad y direccionalidad de las translocaciones de la concha de abanico en el Perú han sido pobremente documentadas.

Recolección y purificación del ADN

Entre agosto de 2014 y febrero de 2015, los investigadores recolectaron individuos de concha de abanico de poblaciones silvestres de Sechura, Lobos de Tierra, Samanco y Bahía Independencia en el Perú, y de La Rinconada en Chile.

Los investigadores desarrollaron y secuenciaron seis librerías genómicas RAD que produjeron aproximadamente 260 millones de secuencias. “Después de la selección inicial, más de 225 mil secuencias fueron usadas para los análisis adicionales” destacan los investigadores.

Diversidad genética

De acuerdo con los resultados del estudio, la población de concha de abanico de Bahía Independencia exhibió la más alta heterocigosidad observada; mientras que la población de Samanco exhibió los valores más bajos.

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Asimismo, los individuos de concha de abanico de Bahía Independencia presentaron la mayor diversidad de nucleótidos; mientras que los individuos de Samanco exhibieron la diversidad más baja. La población de Samanco exhibió el coeficiente de consanguinidad estimado más alto, mientras que Lobos de Tierra y Sechura tuvieron los más bajos.

“Las poblaciones de Sechura y Samanco tuvieron las más bajas diversidades genética estimadas. Estas dos poblaciones están cercanas a criaderos, así que los bajos niveles de diversidad podría ser el resultado de migrante provenientes de ellos” informan.

El estudio destaca que Samanco y La Rinconada exhibieron los más altos coeficientes de consanguinidad, mientras que Lobos de Tierra y Sechura exhibieron los niveles más bajos. “El excedente de homocigotos se puede explicar por la autofertilización provocada por la circulación cerrada en estas bahías” explican los investigadores.

Conclusión

“Nuestros resultados sugieren que la similitud genética entre las poblaciones peruanas es una huella de translocaciones de semillas provocadas por el hombre a largo plazo, más allá de lo que se esperaría por la dispersión de larvas y factores oceanográficos” concluyen los investigadores.

Ellos finalizan indicando que la trazabilidad de individuos de poblaciones silvestres o acuícolas usando marcadores moleculares sería difícil, pero no invalidan el uso de descriptores de población, como índice de parentesco o consanguinidad, como alternativas.

El estudio fue financiado por una subvención del programa Innovate Perú del Ministerio de la Producción (PRODUCE).

Contacto:
Sergio P. Barahona,
Universidad Científica del Sur, Carr. Panamericana Sur 19,
Villa El Salvador, Lima, Perú
Email: sbarahona@ucientifica.edu.pe

Referencia (acceso abierto):
Ximena Velez-Zuazo, Sergio P. Barahona, Omar G. Melo, Eric Hanschke, Ian Hanschke, Monica C. Santa-Maria. Substantial gene flow caused by long-term translocation between wild populations of the Peruvian scallop (Argopecten purpuratus) is supported by RAD-Seq analyses. bioRxiv 2020.09.09.289470; doi: https://doi.org/10.1101/2020.09.09.289470

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