Genética

ShrimpGPAT es una herramienta para compartir el conocimiento y el descubrimiento de los genes en el camarón

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By Milthon Lujan

camaron vannamei vietfishTailandia.- Aun cuando el camarón de cultivo constituye un importante alimento de origen acuático, los biólogos conocen poco sobre el genoma del camarón, por lo que se reduce la capacidad de mejorar la acuicultura del camarón. En este sentido, científicos publicaron una herramienta para compartir y registrar información sobre la genética del camarón y otros crustáceos.

A pesar de la importancia económica de los camarones de cultivo, poco se conoce sobre su reproducción, inmunidad y fisiología, cuando se le compara con otros animales de cultivo como las aves de corral. Aunque las secuencias genómicas de un organismo pueden proveer información sobre sus mecanismos de defensa, no existe un genoma completo para cualquier especie de peneido y los científicos sólo se han limitado a caracterizar la respuesta inmune de los genes del camarón.

La Shrimp Gene and Protein Annotation Tool (ShrimpGPAT) fue concebida como una plataforma de registro y actualización del ADNs (cDNAs), Expressed Sequence Tags (ESTs), y las secuencias de las proteínas del camarón peneido.

ShrimpGPAT contiene las secuencias moleculares de 14 especies de decápodos (aproximadamente 500 000 registros de seis camarones peneidos y ochos otros decápodos).

ShrimpGPAT es un servicio nuevo, libre y de fácil acceso para la comunidad científica que trabaja con el camarón, provee una base de datos detallada y actualizada de genes y secuencias de proteínas de los decápodos.

Puede acceder a ShrimpGPAT en: http://shrimpgpat.sc.mahidol.ac.th/ShrimpGPATV2/

Referencia:
Parpakron Korshkari, Sirintra Vaiwsri, Timothy W Flegel, Sudsanguan Ngamsuriyaroj, Burachai Sonthayanon and Anuphap Prachumwat. ShrimpGPAT: a gene and protein annotation tool for knowledge sharing and gene discovery in shrimp. BMC Genomics 2014, 15:506  doi:10.1186/1471-2164-15-506.
http://www.biomedcentral.com/content/pdf/1471-2164-15-506.pdf

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