Genética

China inicia el secuenciamiento de los transcriptomas de 1000 especies de peces

Foto del autor

By Milthon Lujan

China.- El China National Genebank (CNGB) anunció el lanzamiento oficial del  1,000 Fish Transcriptome Project (Fish T1K), un estudio diseñado para revelar los misterios del origen, evolución y diversificación del mayor grupo de vertebrados. Los hallazgos permitirán a los científicos implementar enfoques innovadores y estrategias para resolver los problemas en la reproducción, control y prevención de enfermedades, seguridad de los alimentos de origen acuático, y conservación de la biodiversidad.

Fish T1K es único con respecto a otros proyectos de transcriptomas de peces debido a su gran escala y ha que es multidisciplinario e integrador. Todos los datos generados por Fish T1K estarán a disposición a través de CNGB, para asegurar que los científicos puedan aprovechar mejor los nuevos avances y la tendencias en la investigación en peces y el uso de tecnología de secuenciamiento del ARN.

Con más de 32 000 especies, los peces son el grupo más grande y diversos de los vertebrados. Ellos también son un grupo económicamente importantes. A pesar de esto, es importante destacar que, en la actualidad, sólo existen 10 genomas de peces secuenciados. “La falta del transcriptoma de la mayoría de las especies de peces nos motivo a establecer una base de datos a gran escala del transcriptoma para los peces” dijo el Dr. Yong Zhang, Director de CNGB con sede en Shenzhen.

“Fish T1K será la primera red global de investigación en omicas de peces en todo el mundo. Los resultados producidos por este proyecto ayudarán a mejorar nuestro entendimiento de la fisiología comparativa, biogeógrafia de los peces, y a explorar sus incalculables valores médicos, económicos y la importancia ecológica, y sus contribuciones a la seguridad alimentaria y a la conservación de la biodiversidad” destacó Ying Sun, director de Marine Biobank de CNGB, quien liderará el proyecto Fish T1K.

READ  Análisis del microbioma del camarón criado en Malasia y Vietnam

Fish T1K ha reunido un equipo de investigadores de prestigio mundial de organizaciones como CNGB, BGI, George Washington University, Institute of Molecular and Cell Biology (Singapur), Smithsonian National Museum of Natural History, University of Guelph, Yellow Sea Fisheries Research Institute (YSFRI) of Chinese Academy of Fishery Sciences (CAFS), Sun Yat-Sen University, Kunming Institute of Zoology of the Chinese Academy of Sciences, South China Sea Institute of Oceanology of the Chinese Academy of Sciences , entre otros. En este proyecto, los científicos planean completar el secuenciamiento y el ensamble de los transcriptomas de 1000 especies de peces en los próximos 3 a 5 años, y establecer una base de datos de transcriptomas de alta calidad para los peces.

El desarrollo del secuenciamiento y de herramientas de bioinformática para generar datos de la expresión genética y el análisis permitirá ejecutar un estudio de transcriptoma a gran escala de los peces. El proyecto está extendiendo una invitación a los científicos de todo el mundo para enviar sus propuestas y contribuir con especímenes de peces para su secuenciamiento.

Deja un comentario