Genética

Descarga los resúmenes del 6to Simposio de Genómica en Acuicultura

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By Milthon Lujan

Entre el 4 y 6 de mayo de 2022 se realizó en Granada (España) el 6th Genomics in Aquaculture (GIA) Symposium. El evento fue organizado por el Departamento de Genética de la Universidad de Granada.

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Los organizadores del evento publicaron los resúmenes presentados en el simposio en la revista Aquaculture Journal; los mismos que puedes descargar de forma libre.

El simposio reunió a investigadores que presentaron y discutieron temas vinculados con el Estrés y la respuesta inmune, Reproducción y crianza, Nutrición y crecimiento, Genómica estructural y genética de poblaciones, Fisiología y desarrollo. Además se publicaron los pósteres presentados durante el evento científico.

Estrés y respuesta inmune

En esta sección se presentaron estudios sobre:

  • Conservación de respuestas transcriptómicas pro-inflamatorias en dos especies de salmónidos,
  • Edición del genoma para investigar la resistencia genética al IPNV en el salmón del Atlántico,
  • Simetría de la expresión génica de Ohnolog en las vías estimuladas por interferón de la carpa común tetraploide,
  • Caracterización del mecanismos de resistencia genética a la anemia infecciosa del salmón en el salmón del Atlántico,
  • Alteraciones del transcriptoma y del metaboloma tras estimulación inmunológica en testículos de pez cebra.
  • Las exposiciones microbianas en la vida temprana dan forma al sistema inmunitario de Crassostrea gigas para la protección contra enfermedades intergeneracionales y de por vida,
  • Identificación de genes que codifican para semioquímicos en salmón del Atlántico (Salmo salar),
  • Uso de snRNA-Seq para dilucidar la resistencia comparativa a los piojos de mar en salmónidos,
  • Selección genómica para la resistencia a enfermedades del copépodo Lernanthropus kroveri en la lubina europea.
  • Secuenciación del genoma completo para refinar la detección de QTL para la necrosis nerviosa viral en la lubina europea (Dicentrarchus labrax),
  • El impacto de la infección por Piscirickettsia salmonis en el perfil de metilación del ADN de todo el genoma en el salmón del Atlántico,
  • Integración de datos genómicos funcionales del huésped-patógeno en un ensamblaje del genoma del rodaballo (Scophthalmus maximus) a nivel cromosómico,
  • Una sola región genómica que implica un supuesto reordenamiento cromosómico en la ostra plana (Ostrea edulis) está asociada con la selección divergente del parásito Bonamia ostreae.

Reproducción y crianza

  • La transcriptómica integrativa revela mecanismos de homeostasis de lípidos en células no endocrinas de la glándula pituitaria de teleósteos,
  • Aplicación de secuenciación de última generación para mejorar el rendimiento reproductivo masculino en salvelino ártico (Salvelinus alpinus) de cultivo,
  • MiRNAs circulantes como biomarcadores de reproducción y calidad del huevo,
  • Contribuciones complementarias de transcripciones y proteínas para el éxito del desarrollo de huevos en lucioperca (Sander lucioperca),
  • Los alelos Vgll3a afectan el eje cerebro-hipófisis-gónada en el salmón del Atlántico (Salmo salar) a través de la regulación de Fshb,
  • Enfoques genómicos combinados para desentrañar la determinación del sexo en la lubina europea,
  • Desarrollo de Biomarcadores Epigenéticos para la Lubina Europea (Dicentrarchus labrax),
  • Pubertad Temprana en Hembras de Lubina Europea, Dicentrarchus labrax: Cambios en la Producción Hormonal y Expresión Génica Ovárica,
  • Edición del genoma para producir peces monosexuales y estériles para acuicultura,
  • Mapeo para machos: control sexual sostenible en la tilapia del Nilo,
  • Un ensamblaje del genoma a nivel cromosómico permite la identificación del receptor de la hormona estimulante del folículo como el gen principal determinante del sexo en Solea senegalensis,
  • Una tecnología para producir progenies exclusivamente femeninas del salmonete de cabeza plana mediante el uso de machos con sexo invertido,
  • Alrededor de las perlas negras: enfoques multiómicos en los programas de mejoramiento para mejorar la calidad de las perlas de la ostra perla del Pacífico,
  • Influencia del Genotipo-Por-Ambiente y la Estrategia del Programa de Mejoramiento en las Ganancias Genéticas Utilizando la Predicción Genómica en Barramundi (Lates calcarifer),
  • Uso del patrón de ascendencia de todo el genoma en la lubina europea para evaluar la variación fenotípica y garantizar una acuicultura sostenible,
  • Optimización de la selección genómica para programas de mejoramiento acuícola en operaciones a pequeña escala y países en desarrollo,
  • Consecuencias de Diferentes Estrategias para Crear Poblaciones Base en el Desempeño de la Selección Genómica,
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Nutrición y crecimiento

  • Dieta a base de plantas complementada con Hermetia illucens en combinación con harina de subproductos avícolas: un paso más cerca de los alimentos acuícolas sostenibles para la lubina europea,
  • Comprensión de la historia de vida temprana en el desarrollo del microbioma intestinal de pescado: lecciones de la tilapia del Nilo,
  • Los antecedentes genéticos impulsan la remodelación del microbioma intestinal mediante aditivos alimentarios en la dorada de cultivo (Sparus aurata),
  • Los nutrientes de 1 carbono impactan el enriquecimiento de la modificación de histonas en el genoma del salmón del Atlántico,
  • Regulación epigenética sensible a nutrientes en músculo de salmón,
  • El manejo estacional de los reproductores influye en la regulación génica epigenética en la progenie del salmón del Atlántico,

Genómica estructural y genética de poblaciones

  • Ensamblaje del genoma a nivel cromosómico para la corvina, Argyrosomus regius,
  • Genoma de referencia de nivel cromosómico para una ostra plana europea británica (Ostrea edulis),
  • Introgresión genómica en criadero de truchas marrones (Salmo trutta L.): desarrollo de un panel de diagnóstico de SNP para el seguimiento de los ríos mediterráneos afectados,
  • ddRAD-Seq revela la estructura genética y detecta señales de selección en la trucha marrón italiana,
  • Detección en todo el genoma de selección positiva en poblaciones de trucha arcoíris,
  • Explotación de la variación intraespecífica en las poblaciones silvestres para mejorar las prácticas de cría selectiva en la acuicultura del salvelino ártico (Salvelinus alpinus),

Fisiología y desarrollo

  • Análisis de la expresión específica de alelos a partir de datos de secuenciación de ARN revela una respuesta dependiente de la salinidad en la tilapia del Nilo,
  • Regulación oxitocinérgica de la respuesta homeostática al estrés por frío en la tilapia del Nilo,
  • Regulación neural de la homeostasis mineral ósea en peces: caracterización funcional y transcripcional de las neuronas pth4,
  • Metamorfosis ocular: decodificación de las redes reguladoras de genes en peces planos,
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Presentaciones en pósteres

  • Efecto protector de bacterias aisladas de la microbiota natural de la ostra del Pacífico Crassostrea gigas contra infecciones por OsHV-1 µVar y Vibrio aestuarianus,
  • Las herramientas genómicas diseñadas en colaboración maximizan tanto la ganancia genética como la eficiencia económica,
  • ß-glucanos como inmunoestimulantes en un modelo de células primarias de leucocitos GALT,
  • Explorando nuevos conocimientos sobre la relación entre el crecimiento y la maduración sexual en la lubina,
  • Variación genética asociada a la selección divergente de Marteilia cochillia en el berberecho común (Cerastoderma edule),
  • Los huevos de diferentes hembras de trucha arcoíris muestran una competencia de desarrollo diferente para la ginogénesis inducida: una perspectiva transcriptómica,
  • Integración de técnicas NGS en el análisis óseo de un pez en miniatura,
  • Análisis exhaustivo del transcriptoma del órgano olfativo en lenguado senegalés (Solea senegalensis) y sus posibles implicaciones en la reproducción de peces,
  • El impacto fisiológico del reemplazo total de harina de pescado con harina de soya en las dietas de trucha arcoíris (Oncorhynchus mykiss): nuevas pistas de los miARN circulantes,
  • Las vías moleculares inducidas por las gonadotropinas recombinantes en Mugil cephalus eran típicas de la ovogénesis natural,
  • Regulación de los niveles de expresión génica por modificación 3’UTR,
  • ¿Se correlaciona la composición de la microbiota con los cambios en la permisividad en el síndrome de mortalidad de la ostra del Pacífico?
  • Adaptación del repertorio de miARN dependiente de la temperatura de las etapas de desarrollo del serviola mayor (Seriola dumerili),
  • Diseño de un chip SNP de baja densidad dirigido a las poblaciones griegas de lubina y dorada,
  • Anotación funcional del genoma de la respuesta de defensa del huésped en inmunomapas generados utilizando el estado inmunológico no estimulado frente al estimulado en dorada (Sparus aurata),
  • Examen de la diversidad genética y la accesibilidad de la cromatina en especies de tilapia relevantes para la acuicultura,
  • Herramientas moleculares para la identificación rápida de especies de Sparidae en el mercado de pescado griego,
  • La asociación de todo el genoma revela marcadores de crecimiento específicos del sexo y relacionados con la domesticación en la tilapia del Nilo,
  • ARN circulares como biomarcadores de crecimiento potencial en tilapia del Nilo,
  • Dirigirse a la modulación de la miogénesis a través de la mediación CRISPR/Cas9 en la tilapia del Nilo cultivada,
  • Nuevos modelos in vitro que utilizan cultivos celulares primarios y edición del genoma para estudiar la resistencia al WSSV en camarones patiblancos del Pacífico,
  • Profundizando en el conocimiento de la vía de determinación y diferenciación sexual en esturiones,
  • La metabolómica aclara las respuestas adaptativas del salmón del Atlántico al estrés y la infección,
  • Cambios transcriptómicos en la hipófisis y los testículos de salmón del Atlántico (Salmo salar) en maduración después de los smolts,
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Referencia (acceso libre)
Ruiz-Rejón, Carmelo, Roberto de la Herrán, Rafael Navajas-Pérez, and Francisca Robles. 2022. «Report on the 6th Genomics in Aquaculture (GIA) Symposium Held in Granada, Spain, 4–6 May 2022» Aquaculture Journal 2, no. 2: 72-163. https://doi.org/10.3390/aquacj2020007

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